Hace 12 años un gigantesco zorro demonio de nueve colas llamado KYUBI apareció, tenía una fuerza incomparable, ningun ninja podía vencerlo, hasta que el 4to Hokage usó un jutsu (técnica), con el que logró sellar el espíritu de la bestia en el cuerpo de un niño recien nacido llamado Naruto.
El deseo del 4to Hokage era que Naruto sea visto como un héroe, porque gracias a él, fue posible encerrar al zorro de nueve colas. Pero la gente de la aldea no lo veían de esa manera, ellos creían que Naruto era el zorro demonio, y lo miraban con odio recordando el desastre que ocurrió. Naruto no entendía porque todos lo miraban de esa manera, ya que estaba prohibido hablar del incidente sucedido, se sentía muy solo hasta que encontró a alguien que si creía en él, este ninja era Iruka, su sensei.
Naruto se presenta para el examen Genin, pero no logra aprobarlo, por ese motivo roba un pergamino, que contiene una serie de jutsus prohibidos, Mizuki le reveló la ubicación de este. Naruto aprende una técnica con la cual salva a su sensei Iruka de Mizuki, al ver esto su sensei gradúa a nuestro personaje principal como un Ninja.
La principal meta de Naruto es convertirse en un Hokage, para que todos lo vean arriba y lo respeten.
Naruto fue asignado al equipo 7 conformado por Sakura Haruto, Sasuke Uchiha, Kakashi Hatake. Así es como comienzan sus aventuras en el camino shinobi ...